自然科學基金按照資助類別可分為面上項目、重點項目、重大項目、重大研究計劃、國家杰出青年科學基金、海外、港澳青年學者合作研究基金、創新研究群體科學基金、國家基礎科學人才培養基金、專項項目、聯合資助基金項目以及國際(地區)合作與交流項目等。
上海市科委設立了上海市自然科學基金,旨在通過資助具有重要科學意義的原始創新和自由探索研究項目,發現優秀科技人才,培育創新源泉,推動本市基礎研究工作。申請人員原則上為具有正高職稱以下(申請數學、天文等理論研究的除外)的在崗科研人員;基金項目的研究期限一般為2-3年,資助額度為10萬元/項。